同时加工贸易企业的两家工厂，由于归属的主管海关不同，手册备案信息差异等问题，都可能导致无法转厂；
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根据四流合一的特点，转厂基本操作流程是由出口再进口构成，涉及运输、报关、报检、仓储协调等环节，现实操作中为了避免信息对接上的失真与及时对问题进行处理，大多选择独立外包，由一家3PL进行处理，以保障服务质量、安全性和及时性。
除了加工贸易企业之间的转厂，在实际贸易中，会存在很多的其它情况：
1、有很多半成品供应商销售产品给成品生产商时遇到困难。成品生产商是加工贸易企业，而供应商是一般贸易企业。成品生产商要求做转厂，供应商无法转厂；
2、同时加工贸易企业的两家工厂，由于归属的主管海关不同，手册备案信息差异等问题，都可能导致无法转厂；
对于以上的问题，通过保税区，可以实现“转厂”操作，达成贸易交货；解决更多非加工贸易企业之间的转厂。
1、一般企业销售产品给加贸企业要用“间接转厂”，就是供应商把产品出口到保税区，加贸企业再用加贸手册从保税区报关进口。这可以完全解决一般制造企业与加贸企业的转厂问题。同时，加贸企业进口是保税的，而供应商出口后可以向税务局申请出口退税。
2、同是加工贸易的两家工厂，因为隶属的主管海关不一样、手册备案的货物信息有差异，通过保税区操作，实现转厂交货的目的。双方工厂分别拿手册资料到保税区海关报关出口或进口，而且载货车辆入区不需卸货，当天即可出区通关进口，实现“一日游”操作（实际只需3个小时左右）。
3、加贸工厂供货给一般工厂，即出口转内销，也是“转厂”模式：加贸工厂将货物以手册保税核销的方式出口到保税区(深圳出口加工区)，一般工厂则以一般贸易的方式征税进口国内。
一种是去到香港，货物从国内去到香港，相当于从国内出国，虽然深圳和香港一条河之隔，但是过去回来相当于出国了，出国了就享受国家退税，虽然物流费增加了，但是和货物的退税相比，还是赚了。还有一种是去到保税区，保税区也相当于国外，进到保税区报关有个海关税单，有了那个税单，就有了出口的凭据
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每种类型的交货方式是怎样的？
1、一般贸易企业之间的交易：可以进行自由的贸易买卖，如果发货方企业需要退税，在深圳坪山保税加工区与周边企业可以通过保税区一日游解决此问题。这是转厂的一种特殊形式。即出口退税。
2、加工贸易型企业之间的交易又分为几种情况：如果交易货物的海关编码相同，可以进行深加工结转；即手册进口，手册出口完成；如果海关编码不同，则需要通过保税区转厂处理，其间根据编码不同的程度（是大类不同还是小类不同），采用不同的转厂方案。
保税物流配送包括多种进出口方式:
一般贸易进出口一般贸易出口货物至深圳出口加工区（出口退税-雄图国际提供深圳出口加工区出口退税服务，货物进区即可申请退税）；从深圳出口加工区一般贸易征税进口。
转关进出口加工贸易企业转关出口货物至深圳出口加工区（出口退税）；从出口加工区转关进口至工厂（保税）。
保税区转厂
保税区(物流园,监管仓)都是有境内关外的政策,即货物从国内进入保税区视同出口,反之等于进口,说白了保税区就等于是国外的地方,国内入保税区则出口,保税区入国内等于进口。所以如果你是一般贸易企业,可以先般正常出囗(与在码头或黄岗正常出口的手续样)到保税区,然后让转入方加工贸易企业在保税区办理进口(手册进口),这样完全附合加工贸易企业的企业性质:加工贸易企业的原材料必需从国外进囗。
保税物流园满足了一日游的一切要件：货物进区立即退税，而且区内企业无论什么性质，都享受统一的税费政策和市场准入待遇。许多针对国内企业收取的监管费用和在货代、船代等方面的限制都取消了。企业只需与物流园区内的注册公司进行合作，在上游，货物进区就视同出口，可以立即退税。而下游企业只需从园区进口货物，拿到发票，向海关以“进料加工”理由申报，就能享受进口料件免缴关税、增值税的待遇。